神惠院與觀音寺分別是四國遍路八十八處的第68號和第69號札所，它們就位於香川縣觀音寺市琴彈山頂之下。這裡獨特的地方在於，它們是四國遍路中僅有的二合一札所，分享同一處場地，就連住持都是同一人。
在江戶時代於1868年結束之前，這兩座寺廟實際上是同一座寺廟。當時的歷史文獻有提到琴彈山上的兩處宗教據點：作為神道教神社的琴彈八幡宮，以及附屬於琴彈八幡宮的佛教寺廟觀音寺。那時候琴彈八幡宮是四國遍路八十八處的第68號札所，觀音寺則緊隨其後。
神道教的神社與佛教的寺廟如此緊密相連看來或許奇怪，但在歷史上，日本本土的神道教信仰與6世紀才進入日本的佛教一直關係密切。但這一切都因為新政府於1868年後的明治時代興起而改變了：日本突然間在長達數世紀的鎖國後對外開放，而新政府決定明確區分兩種宗教，以達成他們為新時代在精神上統一國家的目標。
這種宗教政策的變更導致佛教文物必須從琴彈八幡宮中移除，並轉移至觀音寺境內的西金堂。隨後，西金堂便作為神惠院的本堂而為人所知，使得神惠院取代了琴彈八幡宮，成為四國遍路八十八處的第68號札所。這就是神惠院與觀音寺會座落在同一處場地上、造成今日這種獨特結構的理由。
此處代表著日本文化遺產的重要部分，這也是為什麼觀音寺的本堂（金堂）會被指定為重要文化財。

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